Für die zweite Förderrunde im Programm TRAFO haben die Kulturministerien der sechs Flächenbundesländer, die in der ersten Förderperiode noch nicht an TRAFO beteiligt waren, in 2018 jeweils zwei Regionen in Schleswig-Holstein, Mecklenburg-Vorpommern, Sachsen-Anhalt, Sachsen, Nordrhein-Westfalen, Hessen, Thüringen, Rheinland-Pfalz und Bayern vorgeschlagen.
Über einen Zeitraum von anderthalb Jahren förderte TRAFO diese 18 Regionen bei der Entwicklung eines ein Transformationsprojektes: Wunsiedel, Amberg-Sulzbach, Werra-Meißner-Kreis, Vogelsbergkreis, Uecker-Randow, Mestlin, Minden-Lübbecke, Sauerland, Westpfalz, Mittelrheintal, Oberlaustiz, Markneukirchen, Köthen, Mansfeld Südharz, Nordfriesland, Rendsburg-Eckernförde, Altenburger Land und Wartburgkreis. Sechs davon wurden als Modellregionen der zweiten Förderrunde ausgewählt.